Великоустюгский музей-заповедник – крупный многопрофильный музейный комплекс, объединяющий 27 памятников архитектуры федерального значения. Особую ценность представляют собор Успения Пресвятой Богородицы (XVII–XVIII вв.), собор Прокопия Праведного (XVII–XIX вв.), Михайло-Архангельский собор (XVII в.), Троицкий собор Троице-Гледенского монастыря (XVII–XVIII вв.), церковь Вознесения (XVII в.), церковь Симеона Столпника (XVIII в.), церковь Дмитрия Солунского (XVIII в.). В интерьерах храмов сохранились резные золочёные многоярусные барочные иконостасы XVIII века.

В 2007 году завершено создание современного депозитария – хранилища музейных фондов. Здесь разместились собственно хранилища, экспозиции открытого (то есть доступного для посетителей) хранения, реставрационные мастерские и лекционно-выставочный зал. В фондах хранится более 114 тысяч предметов, нередко уникальных. Музей-заповедник обладает редкими коллекциями иконописи, культовой скульптуры, этнографии, нумизматики, черни по серебру, резьбы и росписи по бересте, редких книг и документов.

В залах музея ежегодно открывается более 10 новых выставок, постоянно обновляются экспозиции. Объектом музейного показа являются также памятники архитектуры XVII–XVIII веков с сохранившимися иконостасами и монументальной живописью.

В 2014 году в Великом Усюге был открыт Детский музейный центр. Он находится в одном из лучших памятников гражданской архитектуры города – доме Аленёвых-Чебаевских. Главное направление работы центра – проведение детских художественных выставок и выставок для детей, детских конкурсов и фестивалей.